Во время осады ближневосточной крепости Акра очень тяжёлая ситуация сложилась в сфере медицинского обслуживания армии крестоносцев. Болезни косили солдат, госпитали были перегружены, к тому же иоанниты беспокоились в первую очередь об англичанах и французах. Тогда некоторые выходцы из Германии, в основном из городов Бремен и Любек, решили создать свой госпитальный орден. Чтобы позаботиться о раненых и больных. Эта инициатива была поддержана представителем германской знати герцогом Фридрихом Гогенштауфеном. Новый монашеский орден был быстро утверждён. Новое братство получило название - Немецкий орден Госпиталя Св. Марии. К 1197 году, когда на Ближний Восток прибыло новое войско крестоносцев, орден уже процветал. Он теперь не только заботился о больных, но и снабжал продовольствием, помогал с жильем, снабжением, тем кто был беден, или по дороге ограблен, потерял всё в бою. Бремен оказывал ордену материальную поддержку.
По второй версии - во время 3-го крестового похода, когда рыцари осаждали Акру, купцы из Любека и Бремена основали полевой госпиталь. Герцог Фридрих Швабский преобразовал госпиталь в духовный орден, во главе которого встал капеллан Конрад. Орден подчинялся местному епископу и был отделением ордена Иоаннитов. 5 марта 1196 года в храме Акры состоялась церемония реорганизации ордена в духовно-рыцарский. На церемонии присутствовали магистры госпитальеров и тамплиеров, а также светские и духовные лица Иерусалима. Папа Римский Иннокентий III подтвердил это событие буллой, датированной 19 февраля 1199 года, и определил задачи ордена: защита немецких рыцарей, лечение больных, борьба с врагами католической церкви. Орден был подвластен Папе Римскому и императору Священной Римской империи.
